La Cattedrale in origine era suddivisa in cinque navate con un’unica abside, colonne in mattoni e pilastri che sorreggevano volte a sesto acuto, il soffitto a carena era decorato con stelle d’oro in un cielo blu cobalto. La zona presbiterale era scandita da un arco decorato a mosaico. La seconda fase costruttiva risale al 1500, quando l’absidiola venne inglobata nell’abside cilindrica progettata da Biagio Rossetti. Un ulteriore cambiamento risale al 1636, quando fu costruito il transetto dall’architetto Luca Danesi. Negli anni 1712-1728, l’architetto Mazzarelli rivoluziona gli spazi interni, suddividendo la planimetria in tre navate che si incrociano ad altrettanti bracci trasversali di eguali dimensioni, coronati da calotte emisferiche.L’interno prende luce da grandi finestroni.